Professor Kruse ist Biologe und leitete von Beginn an zuerst die FhG-IBMT Arbeitsgruppe in Lübeck, aus der dann die EMB hervorgegangen ist. Er wechselte als Leiter der Arbeitsgruppe „Intrazelluläre Transporte“ vom Institut für Medizinische Molekularbiologie der Universität zu Lübeck zur Fraunhofer-Gesellschaft. Er ist Mitglied der Sektionen Informatik/Technik und Naturwissenschaften sowie der Sektion Medizin der Universität zu Lübeck. Professor Kruse studierte Marine Ökologie und promovierte 1993 auf dem Gebiet der Fischphysiologie. Im Jahre 2000 habilitierte er sich in dem Fachgebiet Molekulare Biologie und vertritt in der Lehre das Fach Zellbiologie.